上海市公共卫生临床中心是全国传染病医师进修教育培训基地、中国疾病预防控制中心艾滋病临床进修教育基地、上海市疾病控制中心临床基地；复旦大学传染病国家教育部重点学科组成部分，复旦大学妇产科学国家教育部重点学科组成部分，上海市传染病重点学科建设单位之一；国家级药物临床试验机构资格认定单位；上海市危重孕产妇会诊抢救中心、上海市产科肝病监护中心、上海市艾滋病诊疗中心、上海市新发与再现传染病研究所、国家中医药管理局中医药防治传染病重点研究室（临床基地）建设单位和上海市传染科临床质量控制中心之挂靠单位。19年底疫情以来，上百家单位来考察学习最先进的疫情防治经验。